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समानता और अंतर के क्षेत्रों को प्रकट कर सकता है जिससे वैज्ञानिकों को मानव जीन की संरचना और कार्य को बेहतर ढंग से समझने में मदद मिलेगी। एन्सेम्बल, यूसीएससी जीनोम ब्राउज़र और एनसीबीआई मैप व्यूअर सहित सभी जीनोम ब्राउज़र (12,50,51), महीन दाने वाले डीएनए-डीएनए संरेखण, ऑर्थोलॉगस प्रोटीन जानकारी और बड़े पैमाने पर सिन्टेनी के बहु-प्रजाति डेटासेट को व्यवस्थित और एकीकृत कर रहे हैं।
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